warbleR：簡化生物聲學分析 ================

warbleR 旨在 促進在 R 中分析動物聲學訊號結構。 使用者可收集開放存取的鳥類錄音，或將自己的 資料輸入到一個有助於頻譜圖視覺化及 聲學參數測量的工作流程。 warbleR 利用 seewave 套件的基本聲音分析工具，並提供新的 聲學結構分析工具。這些工具可用於 批次分析聲學訊號。

此套件的主要特色包括：

• 多樣化的聲學結構測量工具
• 使用迴圈將任務套用至在

• 在工作目錄中產生包含頻譜圖的圖片，

本套件提供以下功能：

• 探索並下載 Xeno‐Canto 錄音
• 探索、整理及操作多個音檔
• 自動偵測訊號（於頻率及時間上）（但建議參考 R

• 建立完整錄音或個別訊號的頻譜圖
• 執行不同的聲學信號結構測量方法
• 評估測量方法的效能
• 編目信號
• 描述聲學信號中的不同結構層級
• 對二重奏協調進行統計分析
• 整合資料庫和註釋表格

安裝

可依下列方式從 CRAN 安裝/載入套件：

`` r install.packages("warbleR")

load package

要從 github 安裝最新的開發版，
您將需要 R 套件 remotes：

使用方法

此套件包含數個說明文件，解釋其主要功能。 warbleR簡介 提供了套件功能的總覽。說明文件 註釋資料格式 詳細說明了輸入註釋所需的格式。此外還有三個其他套件說明文件，展示如何在聲學分析工作流程中組織函數。

套件的完整說明（雖然有些過時）可以在這篇期刊文章中找到。

其他套件

seewave和 tuneR這兩個套件提供了大量聲學分析及操作的函數。它們主要針對已經導入R環境的波形物件進行操作。 baRulho套件專注於量化棲地對聲學訊號造成的退化，其資料輸入與輸出與 warbleR相似。套件 Rraven促進R與Raven聲音分析軟體（康奈爾鳥類學實驗室）之間的資料交換，對於將Raven作為註釋工具整合進R的聲學分析工作流程非常有幫助。套件 ohun可自動偵測聲音事件，並提供診斷及最佳化偵測流程的函數。dynaSpec則可用來製作動態頻譜圖（即頻譜影片）。

引用

請按照以下方式引用 warbleR：

Araya-Salas, M. 和 Smith-Vidaurre, G. (2017)，*warbleR: an r package to streamline analysis of animal acoustic signals*。Methods Ecol Evol. 8， 184-191。

注意：如果您使用任何產生聲譜圖或聲學測量的函數，請同時引用 tuneR 和 seewave 套件

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