warbleR：簡化生物聲學分析 ================

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warbleR 旨在協助 在 R 中分析動物聲學信號的結構。使用者可以收集開放存取的鳥類錄音或將自己的 數據輸入到工作流程中，以便促進聲譜圖的視覺化和 聲學參數的測量。 warbleR 利用 seewave 套件的基本聲音分析工具，並提供新的 聲學結構分析工具。這些工具可用於 聲學信號的批次分析。

該套件的主要功能包括：

• 多樣化的聲學結構測量工具
• 使用迴圈將任務應用於在

• 在工作目錄中產生帶有聲譜圖的圖像，

該套件提供以下函數：

• 探索及下載 Xeno‐Canto 錄音
• 探索、組織及操作多個聲音檔案
• 自動檢測信號（在頻率和時間上）（但請參考 R

• 建立完整錄音或個別信號的聲譜圖
• 執行不同的聲學信號結構測量
• 評估測量方法的效能
• 編目信號
• 描述聲學信號中的不同結構層次
• 二重唱協調的統計分析
• 整合資料庫及註釋表格

效率。也提供評估每一步分析表現的工具。

安裝

可依下列方式從 CRAN 安裝／載入套件：

`` r install.packages("warbleR")

load package

要從 github 安裝最新的開發版，
您將需要 R 套件 remotes：

使用方法

此套件包含數個說明文件，解釋其主要功能。 warbleR簡介 提供了套件功能的總覽。說明文件 註釋資料格式 詳細說明了輸入註釋所需的格式。此外還有三個其他套件說明文件，展示如何在聲學分析工作流程中組織函數。

套件的完整說明（雖然有些過時）可以在這篇期刊文章中找到。

其他套件

seewave和 tuneR這兩個套件提供了大量聲學分析及操作的函數。它們主要針對已經導入R環境的波形物件進行操作。 baRulho套件專注於量化棲地對聲學訊號造成的退化，其資料輸入與輸出與 warbleR相似。套件 Rraven促進R與Raven聲音分析軟體（康奈爾鳥類學實驗室）之間的資料交換，對於將Raven作為註釋工具整合進R的聲學分析工作流程非常有幫助。套件 ohun可自動偵測聲音事件，並提供診斷及最佳化偵測流程的函數。dynaSpec則可用來製作動態頻譜圖（即頻譜影片）。

引用

請按照以下方式引用 warbleR：

Araya-Salas, M. 和 Smith-Vidaurre, G. (2017)，*warbleR: an r package to streamline analysis of animal acoustic signals*。Methods Ecol Evol. 8， 184-191。

注意：如果您使用任何產生聲譜圖或聲學測量的函數，請同時引用 tuneR 和 seewave 套件

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