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warbleR

⭐ 62 stars Simplified Chinese by maRce10

warbleR:简化生物声学分析 ================

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生命周期 状态 项目状态:活跃 项目已达到稳定、可用状态
并正在积极
开发。 许可证:GPL
v3 CRAN_状态_徽章 总下载量 Codecov 测试</p><p>coverage

warbleR logo

warbleR 旨在 促进动物声学信号结构在 R 中的分析。用户可以收集开放获取的鸟类录音或将自己的 数据输入到工作流程中,从而方便声谱图可视化和 声学参数测量。 warbleR 利用 seewave 包的 基础声音分析工具,并提供新的 声学结构分析工具。这些工具可用于 批量分析声学信号。

该包的主要功能包括:

声学信号 以便用户整理数据并验证声学分析

该包提供以下功能:

ohun 以获得更全面和友好的实现) 大多数函数支持任务并行化,这可以 将任务分配给多个处理器以提升计算

效率。还提供了工具来评估每一步分析的性能。

安装

按照如下方式从 CRAN 安装/加载该软件包:

`` r install.packages("warbleR")

load package

library(warbleR)

要从github安装最新的开发版本,您需要R包
remotes

r remotes::install_github("maRce10/warbleR")

load package

library(warbleR)
``

使用方法

该软件包包含多个小插图,详细说明其主要功能。warbleR简介提供了软件包功能的概述。注释数据格式小插图详细描述了输入注释所需的格式。此外还有三个额外的软件包小插图,提供了在声学分析工作流中组织函数的示例。

关于该软件包的完整描述(虽然有些过时)可参见这篇期刊文章

其他软件包

seewavetuneR这两个软件包提供了大量用于声学分析和处理的函数。它们主要针对已导入到R环境中的波形对象进行操作。baRulho软件包专注于量化栖息地诱导的声学信号退化,数据输入和输出类似于warbleRRraven软件包方便在R和Raven声学分析软件康奈尔鸟类学实验室)之间交换数据,非常适合将Raven作为注释工具融入R中的声学分析工作流。ohun软件包用于声音事件的自动检测,提供诊断和优化检测流程的函数。dynaSpec可用于创建动态图谱(即声谱视频)。

引用

请按照以下方式引用 warbleR

Araya-Salas, M. 和 Smith-Vidaurre, G. (2017),*warbleR: an r package to streamline analysis of animal acoustic signals*。Methods Ecol Evol. 8, 184-191。

注意:如果您使用了任何创建频谱图或声学测量的函数,请同时引用 tuneRseewave 软件包

--- Tranlated By Open Ai Tx | Last indexed: 2026-06-13 ---