🌐 Ngôn ngữ

warbleR: Đơn giản hóa Phân tích Âm sinh học ================

logo warbleR

warbleR được thiết kế để hỗ trợ phân tích cấu trúc tín hiệu âm học động vật trong R. Người dùng có thể thu thập các bản ghi chim mở hoặc nhập dữ liệu của mình vào quy trình làm việc giúp trực quan hóa phổ tần và đo lường các tham số âm học. warbleR sử dụng các công cụ phân tích âm thanh cơ bản từ gói seewave, và cung cấp các công cụ mới phân tích cấu trúc âm học. Những công cụ này có thể sử dụng cho phân tích hàng loạt các tín hiệu âm học.

Các tính năng chính của gói bao gồm:

Nhiều công cụ đo lường cấu trúc âm học đa dạng
Sử dụng vòng lặp để thực hiện các tác vụ trên các tín hiệu âm học tham chiếu trong

bảng lựa chọn

Tạo ra hình ảnh trong thư mục làm việc với các phổ âm để

giúp người dùng tổ chức dữ liệu và xác minh các phân tích âm học

Gói cung cấp các hàm để:

Khám phá và tải về các bản ghi Xeno‐Canto
Khám phá, tổ chức và thao tác với nhiều tệp âm thanh
Tự động phát hiện tín hiệu (theo tần số và thời gian) (nhưng hãy xem gói R

ohun để có triển khai toàn diện và thân thiện hơn)

Tạo phổ tần của toàn bộ bản ghi hoặc các tín hiệu riêng lẻ

Chạy các phương pháp đo lường cấu trúc tín hiệu âm học khác nhau
Đánh giá hiệu suất của các phương pháp đo lường
Phân loại các tín hiệu
Đặc trưng các cấp độ cấu trúc khác nhau trong tín hiệu âm học
Phân tích thống kê sự phối hợp song ca
Tổng hợp các cơ sở dữ liệu và bảng chú thích

Hầu hết các chức năng cho phép song song hóa nhiệm vụ, điều này phân phối các nhiệm vụ giữa nhiều bộ xử lý để nâng cao hiệu quả tính toán. Các công cụ để đánh giá hiệu suất phân tích ở mỗi bước cũng có sẵn.

Cài đặt

Cài đặt/tải gói từ CRAN như sau:

``r install.packages("warbleR")

`load package`


library(warbleR)

Để cài đặt phiên bản phát triển mới nhất từ
github bạn sẽ cần gói R
remotes:
 r
remotes::install_github("maRce10/warbleR")
load package
library(warbleR)

Sử dụng

Gói này bao gồm một số tài liệu hướng dẫn giải thích các tính năng chính của nó. Giới thiệu về warbleR cung cấp cái nhìn tổng quan về các chức năng của gói. Tài liệu hướng dẫn Định dạng dữ liệu chú thích đưa ra mô tả chi tiết về định dạng yêu cầu cho dữ liệu chú thích đầu vào. Ngoài ra còn có ba tài liệu hướng dẫn bổ sung với các ví dụ về cách tổ chức các hàm trong quy trình phân tích âm thanh.

Mô tả đầy đủ về gói (mặc dù hơi lỗi thời) có thể được tìm thấy trong bài báo khoa học này.

Các gói khác

Các gói seewave và tuneR cung cấp rất nhiều hàm cho phân tích và xử lý âm thanh. Chúng chủ yếu hoạt động trên các đối tượng sóng đã được nhập vào môi trường R. Gói baRulho tập trung vào việc định lượng sự suy giảm tín hiệu âm thanh do môi trường sống gây ra với đầu vào và đầu ra dữ liệu tương tự như warbleR. Gói Rraven giúp trao đổi dữ liệu giữa R và phần mềm phân tích âm thanh Raven (Cornell Lab of Ornithology) và có thể rất hữu ích để tích hợp Raven như một công cụ chú thích vào quy trình phân tích âm thanh trên R. Gói ohun hoạt động trên việc phát hiện tự động các sự kiện âm thanh, cung cấp các hàm để chẩn đoán và tối ưu hóa quy trình phát hiện. dynaSpec cho phép tạo ra các phổ động (ví dụ: video phổ âm).

Trích dẫn

Vui lòng trích dẫn warbleR như sau:

Araya-Salas, M. và Smith-Vidaurre, G. (2017), *warbleR: một gói r để đơn giản hóa phân tích tín hiệu âm thanh động vật*. Methods Ecol Evol. 8, 184-191.

LƯU Ý: vui lòng trích dẫn cả các gói tuneR và seewave nếu bạn sử dụng bất kỳ chức năng tạo phổ âm hoặc đo lường âm thanh nào

--- Tranlated By Open Ai Tx | Last indexed: 2025-11-15 ---