🌐 Dil

warbleR: Biyoakustik Analizi Kolaylaştırın ================

warbleR logo

warbleR, R'da hayvan akustik sinyallerinin yapısının analizini kolaylaştırmak amacıyla geliştirilmiştir. Kullanıcılar açık erişimli kuş kayıtlarını toplayabilir veya kendi verilerini bir iş akışına ekleyerek spektrografik görselleştirme ve akustik parametrelerin ölçümünü kolaylaştırabilirler. warbleR, seewave paketinin temel ses analiz araçlarını kullanır ve akustik yapı analizi için yeni araçlar sunar. Bu araçlar akustik sinyallerin toplu analizinde kullanılabilir.

Paketin temel özellikleri şunlardır:

Akustik yapı ölçümü için çeşitli araçlar
Akustik sinyallere seçim tablosunda referans verilerek döngülerle görevlerin uygulanması
Spektrogramlarla çalışma dizininde görseller oluşturulması, böylece

kullanıcıların verilerini organize etmesi ve akustik analizleri doğrulaması sağlanır

Paket aşağıdaki işlevleri sunar:

Xeno‐Canto kayıtlarını keşfetmek ve indirmek
Birden çok ses dosyasını keşfetmek, düzenlemek ve manipüle etmek
Sinyalleri otomatik olarak tespit etmek (frekans ve zamanda) (daha kapsamlı

ve kullanışlı bir uygulama için R paketi ohun incelenebilir)

Tam kayıtların veya bireysel sinyallerin spektrogramlarını oluşturmak

Akustik sinyal yapısının farklı ölçülerini çalıştırın
Ölçüm yöntemlerinin performansını değerlendirin
Sinyalleri kataloglayın
Akustik sinyallerdeki farklı yapısal seviyeleri karakterize edin
Düet koordinasyonunun istatistiksel analizi
Veritabanlarını ve açıklama tablolarını birleştirin

Fonksiyonların çoğu görevlerin paralelleştirilmesine izin verir, bu da görevleri birden fazla işlemciye dağıtarak hesaplama verimliliğini artırır. Analizin her aşamasında performansı değerlendirmek için araçlar da mevcuttur.

Kurulum

Paketi CRAN'dan aşağıdaki şekilde yükleyin/başlatın:

``r install.packages("warbleR")

`load package`


library(warbleR)

En son geliştirme sürümünü
github üzerinden yüklemek için
R paketine ihtiyacınız olacak
remotes: r
remotes::install_github("maRce10/warbleR")
load package
library(warbleR)

Kullanım

Paket, ana özelliklerini açıklayan birkaç açıklamalı belge içerir. warbleR’ye Giriş paketin işlevselliklerine genel bir bakış sunar. Açıklama veri formatı gerekli giriş açıklamaları için formatın ayrıntılı bir tanımını verir. Ayrıca, fonksiyonların akustik analiz iş akışında nasıl düzenleneceğine dair örnekler içeren üç ek paket açıklama belgesi bulunmaktadır.

Paketin tam açıklaması (biraz eski olsa da) şu dergi makalesinde bulunabilir.

Diğer paketler

seewave ve tuneR paketleri, akustik analiz ve manipülasyon için çok çeşitli fonksiyonlar sunar. Genellikle, halihazırda R ortamına aktarılmış dalga nesneleri üzerinde çalışırlar. baRulho paketi, akustik sinyallerde habitat kaynaklı bozulmayı niceliksel olarak ölçmeye odaklanır ve veri girişi ile çıkışı warbleR ile benzerdir. Rraven paketi, R ile Raven ses analiz yazılımı (Cornell Kuşbilim Laboratuvarı) arasında veri alışverişini kolaylaştırır ve Raven’ın R’deki akustik analiz iş akışına açıklama aracı olarak dahil edilmesi için oldukça faydalı olabilir. ohun paketi, ses olaylarının otomatik olarak tespitinde çalışır, tespit rutinlerini teşhis ve optimize etmek için fonksiyonlar sağlar. dynaSpec ise dinamik spektrogramlar (yani spektrogram videoları) oluşturmayı sağlar.

Atıf

Lütfen warbleR paketini aşağıdaki şekilde kaynak gösteriniz:

Araya-Salas, M. ve Smith-Vidaurre, G. (2017), warbleR: hayvan akustik sinyallerinin analizini kolaylaştıran bir r paketi. Methods Ecol Evol. 8, 184-191.

NOT: Herhangi bir spektrogram oluşturma veya akustik ölçüm fonksiyonu kullanıyorsanız lütfen tuneR ve seewave paketlerini de kaynak gösteriniz

--- Tranlated By Open Ai Tx | Last indexed: 2025-11-15 ---