warbleR: Biyoakustik Analizi Kolaylaştırın ================

warbleR logo

warbleR, R'da hayvan akustik sinyallerinin yapısının analizini kolaylaştırmak için tasarlanmıştır. Kullanıcılar açık erişimli kuş kaydı toplayabilir ya da kendi verilerini akustik parametrelerin spektrografik görselleştirilmesi ve ölçülmesini kolaylaştıran bir iş akışına girebilirler. warbleR, seewave paketinin temel ses analizi araçlarını kullanır ve akustik yapı analizi için yeni araçlar sunar. Bu araçlar, akustik sinyallerin toplu analizinde kullanılabilir.

Paketin temel özellikleri şunlardır:

Akustik yapının ölçümü için çeşitli araçlar
Bir seçim tablosunda referans verilen akustik sinyaller üzerinden görevleri uygulamak için döngülerin kullanımı
Kullanıcıların verileri düzenlemesine ve akustik analizleri doğrulamasına olanak tanıyan çalışma dizininde spektrogramlarla görüntü üretimi

Paket şu işlevleri sunar:

Xeno‐Canto kayıtlarını keşfetme ve indirme
Birden fazla ses dosyasını keşfetme, düzenleme ve işleme
Sinyalleri otomatik olarak algılama (frekans ve zamanda) (ancak daha kapsamlı ve kullanıcı dostu bir uygulama için ohun R paketine bakınız)
Tüm kayıtların ya da bireysel sinyallerin spektrogramlarını oluşturma
Akustik sinyal yapısının farklı ölçümlerini gerçekleştirme
Ölçüm yöntemlerinin performansını değerlendirme
Sinyalleri kataloglama
Akustik sinyallerde farklı yapısal seviyeleri karakterize etme
Düet koordinasyonunun istatistiksel analizi
Veritabanlarını ve açıklama tablolarını birleştirme

Fonksiyonların çoğu, görevlerin paralel olarak yürütülmesine olanak tanır ve bu da görevlerin birden fazla işlemciye dağıtılarak hesaplama

verimlilik. Analizin her adımındaki performansı değerlendirmek için araçlar da mevcuttur.

Kurulum

Paketi CRAN üzerinden aşağıdaki şekilde kurun/yükleyin:

``r install.packages("warbleR")

`load package`


library(warbleR)

En son geliştirme sürümünü
github üzerinden yüklemek için
R paketine ihtiyacınız olacak
remotes: r
remotes::install_github("maRce10/warbleR")
load package
library(warbleR)

Kullanım

Paket, ana özelliklerini açıklayan birkaç açıklamalı belge içerir. warbleR’ye Giriş paketin işlevselliklerine genel bir bakış sunar. Açıklama veri formatı gerekli giriş açıklamaları için formatın ayrıntılı bir tanımını verir. Ayrıca, fonksiyonların akustik analiz iş akışında nasıl düzenleneceğine dair örnekler içeren üç ek paket açıklama belgesi bulunmaktadır.

Paketin tam açıklaması (biraz eski olsa da) şu dergi makalesinde bulunabilir.

Diğer paketler

seewave ve tuneR paketleri, akustik analiz ve manipülasyon için çok çeşitli fonksiyonlar sunar. Genellikle, halihazırda R ortamına aktarılmış dalga nesneleri üzerinde çalışırlar. baRulho paketi, akustik sinyallerde habitat kaynaklı bozulmayı niceliksel olarak ölçmeye odaklanır ve veri girişi ile çıkışı warbleR ile benzerdir. Rraven paketi, R ile Raven ses analiz yazılımı (Cornell Kuşbilim Laboratuvarı) arasında veri alışverişini kolaylaştırır ve Raven’ın R’deki akustik analiz iş akışına açıklama aracı olarak dahil edilmesi için oldukça faydalı olabilir. ohun paketi, ses olaylarının otomatik olarak tespitinde çalışır, tespit rutinlerini teşhis ve optimize etmek için fonksiyonlar sağlar. dynaSpec ise dinamik spektrogramlar (yani spektrogram videoları) oluşturmayı sağlar.

Atıf

Lütfen warbleR paketini aşağıdaki şekilde kaynak gösteriniz:

Araya-Salas, M. ve Smith-Vidaurre, G. (2017), warbleR: hayvan akustik sinyallerinin analizini kolaylaştıran bir r paketi. Methods Ecol Evol. 8, 184-191.

NOT: Herhangi bir spektrogram oluşturma veya akustik ölçüm fonksiyonu kullanıyorsanız lütfen tuneR ve seewave paketlerini de kaynak gösteriniz

--- Tranlated By Open Ai Tx | Last indexed: 2026-06-13 ---