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warbleR: Simplifique a Análise Bioacústica ================

logo warbleR

O warbleR tem como objetivo facilitar a análise da estrutura de sinais acústicos de animais no R. Usuários podem coletar gravações de aves de acesso aberto ou inserir seus próprios dados em um fluxo de trabalho que facilita a visualização espectrográfica e a mensuração de parâmetros acústicos. O warbleR faz uso das ferramentas fundamentais de análise sonora do pacote seewave, e oferece novas ferramentas para análise de estrutura acústica. Essas ferramentas estão disponíveis para análise em lote de sinais acústicos.

As principais características do pacote são:

Diversas ferramentas para medir estrutura acústica
O uso de loops para aplicar tarefas em sinais acústicos referenciados em

uma tabela de seleção

A produção de imagens no diretório de trabalho com espectrogramas para

permitir que usuários organizem dados e verifiquem análises acústicas

O pacote oferece funções para:

Explorar e baixar gravações do Xeno‐Canto
Explorar, organizar e manipular múltiplos arquivos de áudio
Detectar sinais automaticamente (em frequência e tempo) (mas confira o pacote R

ohun para uma implementação mais completa e amigável)

Criar espectrogramas de gravações completas ou sinais individuais
Execute diferentes medidas da estrutura do sinal acústico
Avalie o desempenho dos métodos de medição
Catalogue sinais
Caracterize diferentes níveis estruturais em sinais acústicos
Análise estatística da coordenação de duetos
Consolide bancos de dados e tabelas de anotação

A maioria das funções permite a paralelização de tarefas, o que distribui as tarefas entre vários processadores para melhorar a eficiência computacional. Ferramentas para avaliar o desempenho da análise em cada etapa também estão disponíveis.

Instalação

Instale/carregue o pacote a partir do CRAN da seguinte forma:

``r install.packages("warbleR")

`load package`


library(warbleR)
Para instalar a versão de desenvolvimento mais recente do
github você precisará do pacote R
remotes: r
remotes::install_github("maRce10/warbleR")
load package
library(warbleR)

Uso

O pacote inclui vários vinhetas explicando suas principais funcionalidades. O Introdução ao warbleR fornece uma visão geral das funcionalidades do pacote. O vinheta Formato de dados de anotação dá uma descrição detalhada do formato necessário para as anotações de entrada. Há também três vinhetas do pacote adicionais com exemplos de como organizar funções em um fluxo de trabalho de análise acústica.

Uma descrição completa do pacote (embora um pouco desatualizada) pode ser encontrada neste artigo de revista.

Outros pacotes

Os pacotes seewave e tuneR fornecem uma enorme variedade de funções para análise e manipulação acústica. Eles trabalham principalmente com objetos wave já importados para o ambiente R. O pacote baRulho foca em quantificar a degradação induzida pelo habitat em sinais acústicos com dados de entrada e saída semelhantes aos do warbleR. O pacote Rraven facilita a troca de dados entre R e o software de análise sonora Raven (Cornell Lab of Ornithology) e pode ser muito útil para incorporar o Raven como ferramenta de anotação no fluxo de trabalho de análise acústica no R. O pacote ohun trabalha com detecção automatizada de eventos sonoros, fornecendo funções para diagnosticar e otimizar rotinas de detecção. dynaSpec permite criar espectrogramas dinâmicos (ou seja, vídeos de espectrograma).

Citação

Por favor, cite warbleR como segue:

Araya-Salas, M. e Smith-Vidaurre, G. (2017), *warbleR: um pacote r para simplificar a análise de sinais acústicos de animais*. Methods Ecol Evol. 8, 184-191.

NOTA: por favor, cite também os pacotes tuneR e seewave caso utilize quaisquer funções de criação de espectrogramas ou medição acústica

--- Tranlated By Open Ai Tx | Last indexed: 2025-11-15 ---