🌐 Język

warbleR: Usprawnienie Analizy Bioakustycznej ================

logo warbleR

warbleR został zaprojektowany, aby ułatwić analizę struktury sygnałów akustycznych zwierząt w R. Użytkownicy mogą pobierać ogólnodostępne nagrania ptaków lub wprowadzać własne dane do przepływu pracy, który umożliwia spektrograficzną wizualizację oraz pomiar parametrów akustycznych. warbleR wykorzystuje podstawowe narzędzia analizy dźwięku z pakietu seewave oraz oferuje nowe narzędzia do analizy struktury akustycznej. Narzędzia te dostępne są do analizy zbiorczej sygnałów akustycznych.

Główne cechy pakietu to:

Różnorodne narzędzia do pomiaru struktury akustycznej
Wykorzystanie pętli do wykonywania zadań na sygnałach akustycznych odwołanych w

tabeli selekcji

Tworzenie obrazów w katalogu roboczym z spektrogramami, aby

umożliwić użytkownikom organizację danych i weryfikację analiz akustycznych

Pakiet oferuje funkcje do:

Przeglądania i pobierania nagrań z Xeno‐Canto
Przeglądania, organizowania i manipulowania wieloma plikami dźwiękowymi
Automatycznego wykrywania sygnałów (w częstotliwości i czasie) (ale sprawdź pakiet R

ohun dla bardziej kompleksowego i przyjaznego wdrożenia)

Tworzenia spektrogramów całych nagrań lub pojedynczych sygnałów
Uruchamiaj różne miary struktury sygnału akustycznego
Oceń wydajność metod pomiarowych
Kataloguj sygnały
Scharakteryzuj różne poziomy strukturalne w sygnałach akustycznych
Analiza statystyczna koordynacji duetów
Konsoliduj bazy danych i tabele adnotacji

Większość funkcji umożliwia równoległe wykonywanie zadań, co rozdziela zadania między kilka procesorów, aby zwiększyć wydajność obliczeniową. Dostępne są także narzędzia do oceny skuteczności analizy na każdym etapie.

Instalacja

Zainstaluj/załaduj pakiet z CRAN w następujący sposób:

``r install.packages("warbleR")

`load package`


library(warbleR)
Aby zainstalować najnowszą wersję rozwojową z
github będziesz potrzebować pakietu R
remotes: r
remotes::install_github("maRce10/warbleR")
load package
library(warbleR)

Użytkowanie

Pakiet zawiera kilka winiet wyjaśniających jego główne funkcje. Wprowadzenie do warbleR daje przegląd funkcjonalności pakietu. Winieta Format danych adnotacyjnych zawiera szczegółowy opis wymaganego formatu dla danych wejściowych adnotacji. Istnieją także trzy dodatkowe winiety pakietu z przykładami jak organizować funkcje w przepływie pracy analizy akustycznej.

Pełny opis pakietu (choć nieco przestarzały) znajduje się w tym artykule naukowym.

Inne pakiety

Pakiety seewave oraz tuneR oferują ogromną różnorodność funkcji do analizy i manipulacji dźwiękiem. Działają głównie na obiektach falowych już zaimportowanych do środowiska R. Pakiet baRulho skupia się na ilościowym określaniu degradacji sygnałów akustycznych spowodowanej środowiskiem, przy wejściach i wyjściach podobnych do tych w warbleR. Pakiet Rraven ułatwia wymianę danych między R a oprogramowaniem do analizy dźwięku Raven software (Cornell Lab of Ornithology) i może być bardzo przydatny przy włączaniu Raven jako narzędzia adnotacyjnego do przepływu pracy analizy akustycznej w R. Pakiet ohun służy do automatycznego wykrywania zdarzeń dźwiękowych, oferując funkcje do diagnozowania i optymalizacji procedur wykrywania. dynaSpec umożliwia tworzenie dynamicznych spektrogramów (czyli wideo spektrogramów).

Cytowanie

Proszę cytować warbleR w następujący sposób:

Araya-Salas, M. i Smith-Vidaurre, G. (2017), warbleR: pakiet r do usprawnienia analizy sygnałów akustycznych zwierząt. Methods Ecol Evol. 8, 184-191.

UWAGA: proszę również cytować pakiety tuneR oraz seewave jeśli korzystasz z jakichkolwiek funkcji do tworzenia spektrogramów lub pomiarów akustycznych

--- Tranlated By Open Ai Tx | Last indexed: 2025-11-15 ---