warbleR: 생물음향 분석의 효율화 ================

warbleR logo

warbleR는 R에서 동물 음향 신호의 구조 분석을 용이하게 하기 위해 설계되었습니다. 사용자는 오픈 액세스 조류 녹음 데이터를 수집하거나 자신의 데이터를 입력하여 스펙트로그램 시각화와 음향 파라미터 측정을 쉽게 할 수 있는 워크플로우에 넣을 수 있습니다. warbleR는 seewave 패키지의 기본적인 음향 분석 도구를 활용하며, 음향 구조 분석을 위한 새로운 도구도 제공합니다. 이러한 도구들은 음향 신호의 배치 분석이 가능합니다.

패키지의 주요 특징은 다음과 같습니다:

음향 구조를 측정하는 다양한 도구 제공
선택 테이블에 참조된 음향 신호를 통해 작업을 적용하는 루프 사용
작업 디렉토리 내 스펙트로그램 이미지를 생성하여

사용자가 데이터를 조직하고 음향 분석을 검증할 수 있도록 지원

패키지가 제공하는 함수는 다음과 같습니다:

Xeno‐Canto 녹음 탐색 및 다운로드
여러 음향 파일 탐색, 정리 및 조작
신호 자동 감지(주파수 및 시간 기준) (더 완전하고 사용하기 쉬운 구현을 원한다면 R

패키지 ohun을 확인하세요)

전체 녹음 또는 개별 신호의 스펙트로그램 생성
음향 신호 구조의 다양한 측정 실행
측정 방법의 성능 평가
신호 분류
음향 신호 내 다양한 구조적 수준 특성화
듀엣 조정의 통계 분석
데이터베이스 및 주석 테이블 통합

대부분의 함수는 작업 병렬 처리를 지원하며, 이는 여러 프로세서에 작업을 분산시켜 계산 성능을 향상시킵니다

효율성. 각 단계에서 분석 성능을 평가하는 도구도 제공됩니다.

설치

CRAN에서 다음과 같이 패키지를 설치/로드하세요:

``r install.packages("warbleR")

`load package`


library(warbleR)
최신 개발 버전을 설치하려면  
github에서 R 패키지  
remotes가 필요합니다:   r
remotes::install_github("maRce10/warbleR")
load package
library(warbleR)

사용법

이 패키지는 주요 기능을 설명하는 여러 비네트(vignette)를 포함하고 있습니다. warbleR 소개는 패키지 기능에 대한 개요를 제공합니다. 비네트 주석 데이터 형식은 입력 주석에 필요한 형식에 대해 자세히 설명합니다. 또한 음향 분석 워크플로우에서 함수들을 조직하는 예제를 포함한 세 개의 추가 패키지 비네트가 있습니다.

패키지에 대한 전체 설명(약간 오래되었지만)은 이 학술지 기사에서 확인할 수 있습니다.

기타 패키지

seewave와 tuneR 패키지는 음향 분석과 조작을 위한 다양한 함수들을 제공합니다. 이들은 대부분 이미 R 환경에 불러온 웨이브(wave) 객체에서 작동합니다. baRulho 패키지는 음향 신호의 서식지 유도 열화를 정량화하는 데 중점을 두며, 입력 및 출력 데이터가 warbleR와 유사합니다. Rraven 패키지는 R과 Raven 음향 분석 소프트웨어 (코넬 조류 연구소) 간의 데이터 교환을 용이하게 하며, Raven을 음향 분석 워크플로우에서 주석 도구로 통합하는 데 매우 유용합니다. ohun 패키지는 음향 이벤트의 자동 탐지 기능을 제공하며, 탐지 루틴을 진단 및 최적화하는 함수들을 포함하고 있습니다. dynaSpec는 동적 스펙트로그램(즉, 스펙트로그램 비디오)을 생성할 수 있습니다.

인용

다음과 같이 warbleR를 인용해 주십시오:

Araya-Salas, M. and Smith-Vidaurre, G. (2017), *warbleR: an r package to streamline analysis of animal acoustic signals*. Methods Ecol Evol. 8, 184-191.

참고: 스펙트로그램 생성 또는 음향 측정 함수의 사용 시 tuneR 및 seewave 패키지도 함께 인용해 주시기 바랍니다.

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