🌐 Bahasa

warbleR: Mempermudah Analisis Bioakustik ================

logo warbleR

warbleR bertujuan untuk memfasilitasi analisis struktur sinyal akustik hewan di R. Pengguna dapat mengumpulkan rekaman burung akses terbuka atau memasukkan data mereka sendiri ke dalam alur kerja yang memudahkan visualisasi spektrografik dan pengukuran parameter akustik. warbleR memanfaatkan alat analisis suara mendasar dari paket seewave, serta menawarkan alat baru untuk analisis struktur akustik. Alat-alat ini tersedia untuk analisis batch sinyal akustik.

Fitur utama dari paket ini adalah:

Beragam alat untuk mengukur struktur akustik
Penggunaan loop untuk menerapkan tugas pada sinyal akustik yang direferensikan dalam

tabel seleksi

Produksi gambar di direktori kerja dengan spektrogram untuk

memungkinkan pengguna mengorganisasi data dan memverifikasi analisis akustik

Paket ini menawarkan fungsi untuk:

Menjelajahi dan mengunduh rekaman Xeno‐Canto
Menjelajahi, mengorganisasi, dan memanipulasi banyak file suara
Mendeteksi sinyal secara otomatis (dalam frekuensi dan waktu) (namun cek paket R

ohun untuk implementasi yang lebih lengkap dan ramah)

Membuat spektrogram dari rekaman lengkap atau sinyal individual
Jalankan berbagai ukuran struktur sinyal akustik
Evaluasi kinerja metode pengukuran
Katalogkan sinyal
Karakterisasi tingkat struktural yang berbeda dalam sinyal akustik
Analisis statistik koordinasi duet
Konsolidasikan basis data dan tabel anotasi

Sebagian besar fungsi memungkinkan paralelisasi tugas, yang mendistribusikan tugas di antara beberapa prosesor untuk meningkatkan efisiensi komputasi. Alat untuk mengevaluasi kinerja analisis pada setiap langkah juga tersedia.

Instalasi

Instal/muat paket dari CRAN sebagai berikut:

``r install.packages("warbleR")

`load package`


library(warbleR)

Untuk menginstal versi pengembangan terbaru dari
github Anda akan membutuhkan paket R
remotes:
 r
remotes::install_github("maRce10/warbleR")
load package
library(warbleR)

Penggunaan

Paket ini mencakup beberapa vignette yang menjelaskan fitur utamanya. Intro ke warbleR menyediakan gambaran umum tentang fungsi-fungsi dalam paket ini. Vignette Format data anotasi memberikan deskripsi rinci tentang format yang diperlukan untuk anotasi masukan. Ada juga tiga vignette paket tambahan dengan contoh cara mengorganisasi fungsi dalam alur kerja analisis akustik.

Deskripsi lengkap tentang paket ini (meskipun sedikit usang) dapat ditemukan dalam artikel jurnal ini.

Paket lain

Paket seewave dan tuneR menyediakan banyak fungsi untuk analisis dan manipulasi akustik. Mereka sebagian besar bekerja pada objek wave yang sudah diimpor ke lingkungan R. Paket baRulho berfokus pada kuantifikasi degradasi sinyal akustik yang disebabkan oleh habitat dengan input dan output data yang serupa dengan warbleR. Paket Rraven memfasilitasi pertukaran data antara R dan perangkat lunak analisis suara Raven (Cornell Lab of Ornithology) dan dapat sangat berguna untuk mengintegrasikan Raven sebagai alat anotasi dalam alur kerja analisis akustik di R. Paket ohun digunakan untuk deteksi otomatis kejadian suara, menyediakan fungsi untuk mendiagnosis dan mengoptimalkan rutin deteksi. dynaSpec memungkinkan untuk membuat spektrogram dinamis (yaitu video spektrogram).

Sitasi

Silakan kutip warbleR sebagai berikut:

Araya-Salas, M. dan Smith-Vidaurre, G. (2017), *warbleR: an r package to streamline analysis of animal acoustic signals*. Methods Ecol Evol. 8, 184-191.

CATATAN: mohon juga kutip paket tuneR dan seewave jika Anda menggunakan fungsi-fungsi pembuatan spektrogram atau pengukuran akustik

--- Tranlated By Open Ai Tx | Last indexed: 2025-11-15 ---