warbleR : Rationaliser l’Analyse Bioacoustique ================

warbleR vise à faciliter l'analyse de la structure des signaux acoustiques animaux dans R. Les utilisateurs peuvent collecter des enregistrements aviaires en accès libre ou saisir leurs propres données dans un flux de travail qui facilite la visualisation spectrographique et la mesure des paramètres acoustiques. warbleR utilise les outils fondamentaux d'analyse sonore du package seewave, et propose de nouveaux outils pour l'analyse de la structure acoustique. Ces outils sont disponibles pour l’analyse en lot des signaux acoustiques.

Les principales fonctionnalités du package sont :

• Outils diversifiés pour mesurer la structure acoustique
• Utilisation de boucles pour appliquer des tâches sur des signaux acoustiques référencés dans

• Production d’images dans le répertoire de travail avec des spectrogrammes pour

Le package propose des fonctions pour :

• Explorer et télécharger des enregistrements Xeno‐Canto
• Explorer, organiser et manipuler plusieurs fichiers audio
• Détecter automatiquement des signaux (en fréquence et en temps) (mais consultez le package R

• Créer des spectrogrammes d'enregistrements complets ou de signaux individuels
• Exécuter différentes mesures de la structure du signal acoustique
• Évaluer la performance des méthodes de mesure
• Cataloguer les signaux
• Caractériser différents niveaux structurels dans les signaux acoustiques
• Analyse statistique de la coordination des duos
• Consolider les bases de données et les tableaux d'annotations

Installation

Installez/chargez le package depuis CRAN comme suit :

`` r install.packages("warbleR")

load package

Pour installer la dernière version en développement depuis
github vous aurez besoin du package R
remotes :

Utilisation

Le package comprend plusieurs vignettes expliquant ses principales fonctionnalités. La Introduction à warbleR présente un aperçu des fonctionnalités du package. La vignette Format des données d’annotation fournit une description détaillée du format requis pour les annotations en entrée. Il existe également trois vignettes supplémentaires du package avec des exemples sur la façon d’organiser les fonctions dans un flux de travail d’analyse acoustique.

Une description complète du package (bien que légèrement obsolète) peut être trouvée dans cet article de journal.

Autres packages

Les packages seewave et tuneR offrent une grande variété de fonctions pour l’analyse et la manipulation acoustique. Ils travaillent principalement sur des objets wave déjà importés dans l’environnement R. Le package baRulho se concentre sur la quantification de la dégradation des signaux acoustiques induite par l’habitat avec des entrées et sorties de données similaires à celles de warbleR. Le package Rraven facilite l’échange de données entre R et le logiciel d’analyse sonore Raven (Cornell Lab of Ornithology) et peut être très utile pour incorporer Raven comme outil d’annotation dans un flux de travail d’analyse acoustique sous R. Le package ohun permet la détection automatisée d’événements sonores, fournissant des fonctions pour diagnostiquer et optimiser les routines de détection. dynaSpec permet de créer des spectrogrammes dynamiques (c’est-à-dire des vidéos de spectrogrammes).

Citation

Veuillez citer warbleR comme suit :

Araya-Salas, M. et Smith-Vidaurre, G. (2017), *warbleR : un package R pour faciliter l’analyse des signaux acoustiques animaux*. Methods Ecol Evol. 8, 184-191.

REMARQUE : veuillez également citer les packages tuneR et seewave si vous utilisez des fonctions de création de spectrogrammes ou de mesure acoustique

--- Tranlated By Open Ai Tx | Last indexed: 2025-11-15 ---