warbleR: Optimiza el Análisis Bioacústico ================

warbleR está diseñado para facilitar el análisis de la estructura de señales acústicas animales en R. Los usuarios pueden recopilar grabaciones aviares de acceso abierto o ingresar sus propios datos en un flujo de trabajo que facilita la visualización espectrográfica y la medición de parámetros acústicos. warbleR utiliza las herramientas fundamentales de análisis de sonido del paquete seewave, y ofrece nuevas herramientas para el análisis de la estructura acústica. Estas herramientas están disponibles para análisis por lotes de señales acústicas.
Las principales características del paquete son:
- Diversas herramientas para medir la estructura acústica
- El uso de bucles para aplicar tareas a través de señales acústicas referenciadas en
- La producción de imágenes en el directorio de trabajo con espectrogramas para
El paquete ofrece funciones para:
- Explorar y descargar grabaciones de Xeno‐Canto
- Explorar, organizar y manipular múltiples archivos de sonido
- Detectar señales automáticamente (en frecuencia y tiempo) (pero revisa el paquete de R
- Crear espectrogramas de grabaciones completas o señales individuales
- Ejecutar diferentes medidas de la estructura de la señal acústica
- Evaluar el rendimiento de los métodos de medición
- Catalogar señales
- Caracterizar diferentes niveles estructurales en señales acústicas
- Análisis estadístico de la coordinación de duetos
- Consolidar bases de datos y tablas de anotaciones
Instalación
Instale/cargue el paquete desde CRAN de la siguiente manera:
`` r
install.packages("warbleR")
load package
library(warbleR)
Para instalar la última versión en desarrollo desde
github necesitará el paquete de R
remotes:
r
remotes::install_github("maRce10/warbleR")load package
library(warbleR) ``Uso
El paquete incluye varios viñetas que explican sus principales características. El Intro a warbleR proporciona una visión general de las funcionalidades del paquete. La viñeta Formato de datos de anotación ofrece una descripción detallada del formato requerido para las anotaciones de entrada. También hay tres viñetas adicionales del paquete con ejemplos sobre cómo organizar funciones en un flujo de trabajo de análisis acústico.
Una descripción completa del paquete (aunque un poco desactualizada) se puede encontrar en este artículo de revista.
Otros paquetes
Los paquetes seewave y tuneR ofrecen una gran variedad de funciones para el análisis y manipulación acústica. Principalmente trabajan sobre objetos wave ya importados al entorno de R. El paquete baRulho se enfoca en cuantificar la degradación inducida por el hábitat en señales acústicas con entradas y salidas de datos similares a las de warbleR. El paquete Rraven facilita el intercambio de datos entre R y el software de análisis de sonido Raven software (Cornell Lab of Ornithology) y puede ser muy útil para incorporar Raven como la herramienta de anotación en el flujo de trabajo de análisis acústico en R. El paquete ohun trabaja en la detección automática de eventos sonoros, proporcionando funciones para diagnosticar y optimizar rutinas de detección. dynaSpec permite crear espectrogramas dinámicos (es decir, videos de espectrogramas).
Citación
Por favor cite warbleR como sigue:
Araya-Salas, M. y Smith-Vidaurre, G. (2017), *warbleR: un paquete de r para simplificar el análisis de señales acústicas animales*. Methods Ecol Evol. 8, 184-191.
NOTA: por favor cite también los paquetes tuneR y seewave si utiliza alguna función para crear espectrogramas o medir acústica
--- Tranlated By Open Ai Tx | Last indexed: 2025-11-15 ---